Těsně pod povrchem, pod mrtvým městem Novosibirsk, se plukovník Chlebnikov vydává domů ke svému synovi Kirillovi na Silvestra.
Ale s lidmi tady není všechno v pořádku: sliz dále pohlcuje tunely, útoky mutantů se zdají být na vzestupu a vzácná „zelená hmota“, která chrání lidi před otravou radiací, dochází. Aby bylo zajištěno přežití kteréhokoli z lidí, ti, kteří mají na starosti, možná budou muset přijmout drastická opatření…
V návaznosti na cestu a zážitky Chlebnikova během posledních dnů života v Novosibirsku, které o rok později vykresluje plukovník Miller, se hráči v této nové lineární kapitole mohou těšit na klasický příběhem řízený herní systém série Metro, doplněný o zbrusu novou zbraň, smrtící plamenomet, klaustrofobické prostředí a až příliš známé napětí, z něhož se vstávají vlasy na zem.